2008

1. Ставишенко И.В., Залесов С.В. Флора и фауна природного парка «Самаровский чугас». Ксилотрофные базидиальные грибы // Екатеринбург: Урал. гос. лесотехн. ун-т, 2008. 104 с.

2. Ставишенко И.В. Мониторинг сообществ дереворазрушающих грибов природного парка «Кондинские озера» // Сибирский экологический журнал. 2008. №4. С. 645-654.

3. Ширяев А.Г., Ставишенко И.В. Новые данные об афиллофороидных грибах Висимского заповедника // Микология и фитопатология. 2008. Т. 42. Вып. 2. С. 152-166.

2010 

1. Ставишенко И.В. Состояние лесных сообществ ксилотрофных грибов под воздействием промышленных аэрополлютантов // Экология. 2010. № 5. С. 397-400.

2.  Aphyllophoroid fungi of Sverdlovsk region, Russia: Biodiversity, Distribution, Ecology and IUCN Threat categories / A.G. Shiryaev, H. Kotiranta, V.A. Mukhin, I.V. Stavishenko, N.V. Ushakova. Ekaterinburg: Goshchitskiy Publisher, 2010. 304 p.

3. Ширяев А.Г., Ставишенко И.В. Новые и редкие для Свердловской области виды базидиальных грибов // Микология и фитопатология. 2011. Т. 45. Вып. 4. С. 345-349.

2011

1. Ставишенко И.В., Веселовская А.В. Афиллофоровые грибы заповедника «Нургуш» (Кировская область) // Микология и фитопатология. 2011. Т. 45, вып. 3. С. 260-270.

2. Ставишенко И.В. Основные закономерности преобразования сообществ ксилотрофных грибов под воздействием антропогенных и природно – климатических факторов // Микология Сегодня. Том. 2. Ю.Т. Дьяков, А.Ю. Сергеев (ред.). М.: Национальная академия микологии, 2011. С. 89-108.

3. Ставишенко И.В. Афиллофоровые грибы заповедника «Малая Сосьва» (Западная Сибирь) // Микология и фитопатология. 2011. Т. 45. Вып. 2. С. 147-157.

2012

1. Мониторинг состояния природной среды особо охраняемых природных территорий Свердловской области / Под ред. И.А. Кузнецовой. Екатеринбург: ООО «УИПЦ», 2012. 162 с.

2. Ставишенко И.В. Афиллофоровые и гетеробазидиальные грибы заповедника «Денежкин Камень» (Свердловская область) // Микология и фитопатология. 2012. Т. 46. Вып. 5. С. 311-321.

2. Кузнецова И.А., Коркина И.Н., Ставишенко И.В., Черная Л.В., Чеботина М.Я., Холостов С.Б. К организации комплексного мониторинга состояния природной среды в районе падения отделяющихся частей ракет-носителей на территории Северного Урала // Известия КОМИ НЦ УрО РАН. 2012. № 2. Вып. 10. С. 57-67.

2013

1. Ставишенко И.В., Кшнясев И.А. Реакция лесных сообществ ксилотрофных грибов на аэротехногенное загрязнение: мультимодельный вывод // Изв. РАН. Серия биологическая, 2013. № 4. С. 1-11.

2. Арефьев С.П., Бульонкова Т.М., Звягина Е.А., Светашева Т.Ю., Ставишенко И.В., Филиппова Н.В., Ширяев А.Г. Грибы / Научные ред. Т.Ю. Светашева, Е.А. Звягина // Красная книга Ханты-Мансийского автономного округа: Животные, растения, грибы / Отв. ред.: А. М. Васин, А. Л. Васина. Департамент экологии Ханты-Мансийск. автоном. окр.- Югры Изд. 2-е. Екатеринбург: Баско, 2013. С. 314-353.

3. Ставишенко И. В. Характеристика сообществ дереворазрушающих грибов // Результаты мониторинга состояния природной среды особо охраняемых природных территорий Свердловской области / отв. ред. И. А. Кузнецова. Екатеринбург: УИПЦ, 2013. Ч. 1.3. С. 75-123. 4. Ставишенко И. В. Состояние лесных сообществ дереворазрушающих грибов в районе падения ОЧ РН "Союз" // Результаты мониторинга состояния природной среды особо охраняемых природных территорий Свердловской области / РАН, УрО, Ин-т экологии растений и животных ; [отв. ред. И. А. Кузнецова].-Екатеринбург : УИПЦ, 2013.-Ч. 2.11. - С. 255-264.

2. Ставишенко И.В. Оценка состояния древостоя нарушенных и ненарушенных участков ООПТ на основании определения видового разнообразия дереворазрушающих грибов // Итоги мониторинга состояния природной среды особо охраняемых природных территорий Свердловской области / отв. ред. И.А. Кузнецова. Екатеринбург: Изд-во Урал. ун-та, 2014. С. 75-124.

2015 

1. Ставишенко И.В., Лугинина Е.А. Афиллофороидные грибы государственного природного заказника «Былина» (Кировская область) // Микология и фитопатология. 2015. Т. 49. Вып. 1. С. 41-49.

2. Ставишенко И.В. Оценка состояния лесных сообществ дереворазрушающих грибов // Особо охраняемые природные территории Свердловской области: мониторинг состояния природной среды / отв. ред. И.А. Кузнецова. Екатеринбург: Изд-во Урал. ун-та, 2015. С. 56-110. 

2017 

1. Ставишенко И.В., Змитрович И.В. Первая находка Lignomyces vetlinianus (Tricholomataceae, Agaricomycetes) на Урале // Микология и фитопатология. 2017. Т. 51. Вып. 1. С. 60-63.

3. Ставишенко И.В., Саркина И.С. Результаты инвентаризации афиллофороидных и гетеробазидиальных макромицетов заповедника «Мыс Мартьян» // Научные записки природного заповедника «Мыс Мартьян». 2017. Вып. 8. С. 20-25.

5. Н. В. Филиппова, С. П. Арефьев, Т. М. Бульонкова, Е. А. Звягина, В. И. Капитонов, Т. А. Макарова, В. А. Мухин, И. В. Ставишенко, Е. И. Тавшанжи, А. Г. Ширяев История микологических исследований в Ханты-Мансийском автономном округе. 1. Период разрозненных исследований, изучение сообществ ксилотрофных базидиомицетов и фитопатология //Динамика окружающей среды и глобальные изменения климата. 2017. Т. 8, N 2. С. 18-28.

N. V. Filippova, S. P. Arefyev, T. M. Bulyonkova, E. A. Zvyagina, V. I. Kapitonov, T. A. Makarova, V. A. Mukhin, I. V. Stavishenko, E. I. Tavshanzhi, A. G. Shiryaev The history of mycological studies in Khanty-Mansi autonomous okrug. 1. The period of isolated studies, lignicolous basidiomycetes and phytopathological studies // Environmental dynamics and global climate change. 2017. Vol. 8, N 2. P. 18-28

6. Н. В. Филиппова, С. П. Арефьев, Т. М. Бульонкова, Е. А. Звягина, В. И. Капитонов, Т. А. Макарова, В. А. Мухин, И. В. Ставишенко, Е. И. Тавшанжи, А. Г. Ширяев История  микологических исследований в Ханты-Мансийском автономном округе. 2. изучение макромицетов, лишайников и миксомицетов, состояние коллекций и региональная база находок видов // Динамика окружающей среды и глобальные изменения климата. 2017. Т. 8, N 2. С. 29-45.

N. V. Filippova, S. P. Arefyev, T. M. Bulyonkova, E. A. Zvyagina, V. I. Kapitonov, T. A. Makarova, V. A. Mukhin, I. V. Stavishenko, E. I. Tavshanzhi, A. G. Shiryaev The history of mycological studies in Khanty-Mansi autonomous okrug. 2. Study of Macromycetes, Lichens and Myxomycetes, state of mycological collections and fungal records database // Environmental dynamics and global climate change. 2017. Vol. 8, N 2. P. 29-45

2018 

Ставишенко И.В. Распространение и новые находки редкого вида Auriporia aurulenta (Fomitopsidaceae, Polyporales) на Урале // Микология и фитопатология. 2018. Т. 52. № 6. С. 420-423.

2019  

Zmitrovich I.V., Vlasenko V.A., Stavishenko I.V., Vlasenko A.V. A stipe reduction series in Lentinus substrictus (= Polyporus ciliatus) (Polyporaceae, Agaricomycetes) // Микология и фитопатология. 2019. Т. 53, № 5. С. 319-322.

Volobuev S.V., Bolshakov S. Yu., Shiryaev A.G., Sazanova N.A., Rebriev Yu. A., Ezhov O.N., Vlasenko V.A., Vlasenko A.V., Kalinina L.V., Stavishenko I.V., Zmitrovich I.V. New species for regional mycobiotas of Russia. 4. Report 2019 // Микология и фитопатология. 2019. Т. 53, № 5. С. 261-271.

Макромицеты Государственного природного заказника «Былина»: монография / И.В. Ставишенко, Е.А. Лугинина, Д.В. Кириллов, Т.Л. Егошина; Вятская государственная сельскохозяйственная академия, Институт экологии растений и животных УрО РАН и др. – Киров: Радуга-ПРЕСС, 2019. – 150 с.

 Мухин В.А., Ставишенко И.В., Ширяев А.Г., Ширяева О.С. Ч. 3: Грибы // Красная книга Свердловской области: животные, растения, грибы / Отв. ред. Н. С. Корытин / М-во природ. ресурсов Свердл. обл., Ин-т экологии растений и животных УрО РАН. Екатеринбург: ООО Мир, 2018. С. 394-433.

2020 

Ставишенко И.В. Новые данные об афиллофоровых грибах (Basidiomycota) Ханты-Мансийского автономного округа — Югра (Западная Сибирь) // Новости систематики низших растений. 2020. Т. 54. Вып. 2. С. 387–396. 

Filippova N., Arefyev S., Zvyagina E., Kapitonov V., Makarova N., Mukhin V., Sedelnikova N., Stavishenko I., Shiryaev A., Tolpysheva T., Ryabitseva N., Paukov A. Fungal literature records database of the Northern West Siberia (Russia) // Biodiversity Data Journal. 2020. N 8: e52963. P. 1–24. 

2021

Volobuev S.V., Bolshakov S.Yu., Khimich Yu.R., Shiryaev A.G., Rebriev Yu.A., Potapov K.O., Popov E.S., Kapitonov V.I., Palamarchuk M.A., Kalinina L.B., Kosolapov D.A., Stavishenko I.V., Perevedentseva L.G., Vlasenko V.A., Ezhov O.N., Kirillov D.V., Botyakov V.N., Palomozhnykh E.A., Botalov V.S., Zvyagina E.A., Dejidmaa T., Leostrin A.V., Efimova A.A., Borovichev E.A., Shakhova N.V., Shishigin A.S., Vlasenko A.V., Zmitrovich I.V. New Species for regional mycobiotas of Russia. 6. Report 2021 // Микология и фитопатология (Mikologija i fitopatologija (Mycology and Phytopathology). 2021, Т. 55, № 6, С. 411–422.

Кузнецова И.А., Гилев А.В., Головатин М.Г., Никонова Н.Н., Пустовалова Л.А., Ставишенко И.В., Степанов Л.Н. Мониторинг состояния особо охраняемых природных территорий Свердловской области. Екатеринбург: УрФУ. 2021. 132 с. 

2022

1. Ставишенко И.В., Саркина И.С. Новые для Крымского полуострова виды афиллофороидных грибов // Микология и фитопатология. 2022. Т. 56, № 6. С 452–456.

2. Volobuev S.V., Bolshakov S.Yu., Khimich Yu.R., Shiryaev A.G., Rebriev Yu.A., Potapov K.O., Popov E.S., Kapitonov V.I., Palamarchuk M.A., Kalinina L.B., Kosolapov D.A., Stavishenko I.V., Perevedentseva L.G., Vlasenko V.A., Ezhov O.N., Kirillov D.V., Botyakov V.N., Palomozhnykh E.A., Botalov V.S., Zvyagina E.A. New species for regional mycobiotas of Russia. 6. Report 2021: Drawings of new species to Russia // Mycology and Phytopathology. 2022. Т. 56. № 3. С. 220-222.

2023

Ставишенко И.В., Лугинина Е.А., Оботнин С.И. Афиллофороидные грибы государственного природного заказника «Пижемский» и памятника природы «Урочище Васин бор» // Микология и фитопатология, 2023. Т. 57, вып 5. С. 332-343.

Ставишенко И.В. Оценка состояния сообществ дереворазрушающих грибов // Комплексный экологический мониторинг в природном парке «Бажовские места» / И. А. Кузнецова, А. В. Гилев, М. Г. Головатин и др.; отв. ред. И. А. Кузнецова. Екатеринбург: Изд-во Урал. ун-та, 2023. С. 34–41.

Лугинина Е.А., Ставишенко И.В., Кириллов Д.В. Хозяйственно-полезные макромицеты государственного природного заказника "Былина" / Е. А. Лугинина, И. В. Ставишенко, Д. В. Кириллов // АгроЭкоИнфо: электронный научно-производственный журнал. 2023. N 4 (58). С. 1-8.