На территории Свердловской, Челябинской и Пермской областей составлены геоботанические карты разных масштабов. Они являются составной частью Атласов Свердловской и Челябинской областей и предназначены для широкого круга пользователей как справочное картографическое произведение. Наиболее полно изучен растительный покров Свердловской области. Для этой территории проведено крупномасштабное изучение ресурсного потенциала кормовых и лекарственных растений, составлены карты размещения отдельных видов и авторские макеты среднемасштабных карт.
Для территории Свердловской области впервые в России была проведена оригинальная работа по составлению фитоэкологической карты. На ней отражена информация о последствиях воздействия человека на растительный покров за 300 летний исторический период: показана трансформация зональных подразделений и территориальных комплексов. Опубликована «Фитоэкологическая карта Свердловской области» М: 1:1500000. АОЗТ УГСЭ, Екатеринбург, 1995. Авторский коллектив Горчаковский П.Л., Никонова Н.Н., Фамелис Т.В., Ляхович Э.М. Существует электронный вариант этой карты в программе «ArcView GIS 3.2».
Предполагается создание электронного варианта флористических баз данных на отдельные ландшафтные территории, анализ которых позволит критически осмыслить работу не только предшественников, но и собственные данные. Использование БД и электронных карт будет способствовать более глубокому изучению динамических трендов и разработке достоверных прогнозов по улучшению и сохранению биологических ресурсов.
Фитоэкологическая карта Свердловской области [Карты] [Электронный ресурс]: проект ГИС: на основе Фитоэкологической карты Свердловской области / Ин-т экологии растений и животных УрО РАН и др.; подгот.: Н.А. Полежаев, М.А. Полежаева. — 1:1 500 000. — [Екатеринбург]: Б.и., 2003. — 1 электрон. диск (CD) . — Авт.: Горчаковский П.Л., Никонова Н.Н., Фамелис Т.В., Ляхович Э.М. — Систем. требования: MS Windows 98, Intel Pentium 200 Mhz, 32 Mb RAM, ArcView 3.2.
Ширяев А.Г., Котиранта Х., Мухин В.А., Ставишенко И.В., Ушакова Н.В. Афиллофороидные грибы Свердловской области: Биоразнообразие, распространение, экология и IUCN категории / Екатеринбург: Гощицкий, 2010. 303 с.
Мухин В.А., Котиранта Х., Ушакова Н. В., Ширяев А. Г. Красная книга Челябинской области: Животные, Растения, Грибы / РАН, Уральское Отделение, Институт экологии растений и животных. Екатеринбург Изд-во Урал. ун-та, 2005. Разд. 13 Грибы. С. 400-433
Мухин В.А., Д. В. Веселкин, Е. В. Брындина, О. А. Храмова, Н. В. Ушакова Грибные сообщества лесных экосистем / Ин-т лесоведения РАН [отв. ред. Стороженко В. Г.]. М.; Петрозаводск: Карел. НЦ РАН, 2000. Глава: Основные закономерности современного этапа эволюции микобиоты лесных экосистем. 2000. С. 26-36.
Shiryaev A., Moiseev P., Peintner U., Devi N., Kukarskih V., Elsakov V. Arctic greening caused by warming contributes to compositional changes of mycobiota at the Polar Urals // Forests. 2019. Vol. 10(12). 1112.
Shiryaev A.G. Spatial diversity of clavarioid mycota (Basidiomycota) at the forest-tundra ecotone // Mycoscience. 2018. Vol. 59(4). P. 310-318.