Хрунык Ю.Я.

Primary tabs

Лаборатория филогенетики и биохронологии

Юлия

Ярославовна

Хрунык

Научный сотрудник,
Рh.D

Контактные данные:

Адрес:

620144 г. Екатеринбург, ул. 8 Марта, д. 202

корпус:

главный корпус

Телефон:

+7 (343) 2103858

внутренний номер:

128

e-mail:

juliakhrunyk@yahoo.co.uk

1997 - 2003 – студентка биологического факультета Львовского Национального Университета им. И. Франка (кафедра физиологии и экологии растений), г. Львов, Украина Степень магистра: июнь 2003 Специальность: Биология, Физиология Тема диплома: «Влияние регуляторов роста растений зеастимулина и ивина на ранние стадии развития проростков кукурузы» 2003 – 2005 – магистратура в Университете Аляска Фэрбенкс (Civil and Environmental Engineering Dept.), Фэрбенкс, Аляска, США Степень магистра: май 2005 Специальность: Экологический Менеджмент Тема диплома: «Фиторемедиация почвы: поглощение C14‐атразина степными растениями» 2004, 2005 – научная практика в Университете штата Айова (Iowa State University), Эймс, Айова, США 2006 – 2010 – аспирантура в Институте Макса Планка (Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology), Марбург, Германия Степень Dr. rer. nat. (Doctorate in natural sciences): ноябрь 2010 Тема диссертации: «Использование FLP‐FRT системы спасения маркеров для функционального анализа семейства генов биотрофного гриба Ustilago maydis» 2011 – 2013 – научный сотрудник Уральского научно-исследовательского ветеринарного института РАСХН 2013 – текущее время – научный сотрудник лаборатории филогенетики и биохронологии Института экологии растений и животных УрО РАН

Направления научных исследований:

Исследования докторской диссертации связаны с функциональным анализом генов и семейств генов. На данный момент занимаюсь филогенетическим анализом и эволюцией налима Lota lota, методами выделения и амплификации ДНК из палео-образцов. Кратко, молекулярно-генетические методики исследований включают клонирование, секвенирование ДНК, PCR, RT-PCR, конфокальную микроскопию, выделение и очистку рекомбинантных белков, приготовление протопластов и трансформацию ряда грибов, трансформацию и клонирование генов в E.coli, биоинформатический анализ белковых и нуклеотидных последовательностей, Southern-, Northern-, Western- блоттинги.

Show Основные научные интересы и результаты

Объекты исследований:

налим (Lota lota), головня (Ustilago maydis), вирус лейкоза крупного рогатого скота (bovine leukaemia virus), травы прерий (prairies grasses), кукуруза

Ключевые слова:

налим, Lota lota, грибы, Ustilago maydis, филогенетика, ancient DNA, палео-ДНК, молекулярная биология, молекулярная генетика, вирус лейкоза КРС

Основные научные результаты:

Целью докторской диссертации было использование FLP‐FRT системы спасения маркеров для функционального анализа семейства генов биотрофного гриба Ustilago maydis (головня). Биотрофный паразитический рост данного гриба зависит от секретируемых молекул-эффекторов. Однако секвенирование генома U. maydis (Kaemper at al., 2006) показало, что некоторые эффекторы кодируются семействами генов, и, следовательно, эти эффекторы могут иметь избыточную функцию. В связи с ограниченным количеством селективных маркеров создание мутантов с делецией больше 3-х генов было невозможно. С целью решения этой проблемы в основе моей диссертационной работы было создание индуцируемой системы спасения маркеров на основе FLP рекомбиназы дрожжей Saccharomyces cerevisiae. Далее эту систему я использовала для делеции семейства генов Eff1, состоящей из 11 генов, кодирующих эффекторы. Мутанты с отсутствием 9 или всех 11 генов показали существенное снижение вирулентности, и данный фенотип мог быть частично комплементирован после трансформации мутантов разными генами, принадлежащими к семейству Eff1.

Район исследований:

северное полушарие

Рекомендумые ссылки:

для анализа нуклеотидных и белковых последовательностей

http://www.expasy.org/tools/

Show Достижения

Участие в проектах:

2014-2016, РФФИ 14-04-00614-а, Генетическая и морфологическая изменчивость грызунов на границах видовых ареалов, участник CRDF 2015-2016 Программа Post-doc в УрФУ 2015-2016

Конференции:

2013 Всероссийская конференция с международным участием «Систематика, филогения и палеонтология млекопитающих». 11-14 ноября 2013 года, Санкт-Петербург (Россия)

2009 New Phytologist Symposium Effectors in plant-microbe interactions. 2009, INRA Versailles Research Centre, Paris (France)

2008 IVth International Ustilago meeting. 2008, Rauischholzhausen (Germany)

2004 Annual Association for Environmental Health and Sciences Foundation AEHS. 2004, San Diego, California (USA)

2003 Arctic Science Conference. 2003, Fairbanks, Alaska (USA)

Научно-организационная деятельность:

Член организационного комитета международной конференции INQUA-SEQS "Четвертичный период Урала: Глобальные тенденции и их отражение в общеевропейской четвертичной летописи" ("The Quaternary of the Urals: Global trends and Pan-European Quaternary records") 10-16 сентября 2014г, Екатеринбург, Россия http://inqua-seqs2014.ecology.uran.ru/index.html

Show Публикации

2015 Хрунык Ю.Я., Бородин А.В., Семериков В.Л., Ялковская Л.Э., Копориков А.Р., Ракитин С.Б., Богданов В.Д. Первые данные о генетическом разнообразии налима (Lota lota) Западно-сибирской равнины // ДАН. 2015. Т. 463. № 5. С. 615-618.

Khrunyk et al., 2015 (Burbot) eng.pdf

Khrunyk et al., 2015 (Burbot) rus.pdf

2015 ПАТЕНТ Способ ранней диагностики лейкоза крупного рогатого скота, RU 2013135036/15 от 27.01.2015

Khrunyk_Patent_1.PDF

2014 Y.Y. Khrunyk, A.R. Koporikov, V.D. Bogdanov, A.V. Borodin (2014). GENETIC VARIABILITY OF BURBOT, LOTA LOTA, AND THE CONNECTION OF THE MAIN HOLARCTIC RIVER BASINS IN THE QUATERNARY / The Quaternary of the Urals: Global trends and Pan-European Quaternary records. International conference INQUA-SEQS 2014 (Ekaterinburg, Russia, September 10–16, 2014). Ekaterinburg, 2014. P. 51-53

INQUA2014 _Khrunyk_Y.pdf

2014 Донник И.М., Петропавловский М.В., Хрунык Ю.Я. (2014). Способ выявления вируса лейкоза крупного рогатого скота методом синцитиального теста. В сборнике: Эколого-биологические проблемы использования природных ресурсов в сельском хозяйстве. Редакционная коллегия: Донник И.М., Зезин Н.Н., Шкуратова И.А., Ряпосова М.В., Шилова Е.Н., Исаева А.Г., Печура Е.В. С.: 57-60

2013 Хрунык Ю.Я., Порываева А.П., Бахарев А.А., Вялых И.В., Петропавловский М.В., Шкуратова И.А. (2013). Экспериментальная оценка возможности адгезии и роста клеток, применяемых в ветеринарной вирусологии. В сборнике: Инновационные решения актуальных проблем в АПК. Сборник материалов Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов. Редколлегия: Донник И.М., Зезин Н.Н., Шкуратова И.А., Ряпосова М.В., и др. С.: 207-211

2013 Ракитин С.Б., Копориков А.Р., Богданов В.Д., Хрунык Ю.Я., Ялковская Л.Э., Семериков В.Л., Бородин А.В. (2013). Изменчивость микросателлитной ДНК налима (Lota Lota) Обь-Иртышского бассейна: тестирование праймеров и оптимизация методики // Вестник Астраханского государственного технического университета. Серия: Рыбное хозяйство. 2013. № 3. С. 118-128.

Ракитин и др. 2013.pdf

на сайте "elibrary.ru"

2012 Петропавловский М.В., Донник И.М., Татарчук А.Т., Маркарян А.Ю., Хрунык Ю.Я., Михеев М.П. (2012). Эффективность комплекса диагностических исследований (ПЦР, ИФА, РИД) на ранней стадии выявления вируса лейкоза крупного рогатого скота в оздоровлённых стадах. В Сборнике: Сборник материалов Международной Научно-Практической Конференции Молодых Ученых и Специалистов. Под общей редакцией: И.М. Донник, Н.Н. Зезина, И.А. Шкуратовой, О.В. Соколовой, Е.Н. Шиловой, А.Г. Исаевой. С.: 195-201

2012 Хрунык Ю.Я., Вялых И.В., Петропавловский М.В., Порываева А.П., Бахарев А.А. (2012). Сравнительная характеристика роста клеток, используемых в ветеринарной вирусологии. В сборнике: Научные основы производства и обеспечения качества биологических препаратов для АПК. С.: 247-250

2012 Донник И.М., Татарчук А.Т., Маркарян А.Ю., Петропавловский М.В., Лысов А.В., Хрунык Ю.Я. (2012). Селекция пород крупного рогатого скота, резистентного к вирусу лейкоза крупного рогатого скота. В Сборнике: Сборник Материалов Международной Научно-Практической Конференции Молодых Ученых и Специалистов. Под общей редакцией: И.М. Донник, Н.Н. Зезина, И.А. Шкуратовой, О.В. Соколовой, Е.Н. Шиловой, А.Г. Исаевой. С.: 239-242

2011 Донник И.М., Шкуратова И.А., Татарчук А.Т., Маркарян А.Ю., Лысов А.В., Петропавловский М.В., Михеев М.Т., Хрунык Ю.Я. (2011). Экспериментальные данные по эффективности диагностических исследований на ранних стадиях вирусоносительства вируса лейкоза крупного рогатого скота. // Научные Рекомендации. Екатеринбург.

2011 Хрунык Ю., Романюк Н., Микиевич И., Терек О., Клобус Г. (2011). Активность Н+ АТФ-азы плазмалеммы клеток ростков кукурузы при воздействии регуляторов роста растений. Материалы XIII Съезда Украинского Ботанического Сообщества. Львов. С. 466

2010 Khrunyk, Y., Münch, K., Schipper, K., Lupas, A. N., Kahmann, R. (2010). The use of FLP-mediated recombination for the functional analysis of an effector gene family in the biotrophic smut fungus Ustilago maydis. New Phytol 187(4): 957-68 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=khrunyk

Khrunyk_et_al-2010-New_Phytologist.pdf

2009 Khrunyk, Y., Kahmann, R. (2009) Establishment of FLP-dependent recombination in Ustilago maydis and its use for the functional analysis of effector gene families. 22nd New Phytologist Symposium. Effectors in plant-microbe interactions: 49 https://www.google.ru/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=1&ved=0CCYQ...

2009 Schipper K., Doehlemann G., Brefort T., Djamei A., Liang L., Khrunyk Y., Schirawski J., Kahmann R. (2009). The effectors of smut fungi. In Biology of Molecular Plant-Microbe Interactions, Vol. 7 (2009 IS-MPMI Symposium Proceedings) (H. Antoun et al., eds.) Vol.7, pp1-8.

2007 J.R. Coats, K.L. Henderson, Y. Khrunyk, S. Shiewer (2007). Uptake and transformation of atrazine and metalochlor in prairie grasses for phytoremediation. Society of Environmental Toxicology and Chemistry SETAC North America, 28th Annual Meeting. https://www.google.ru/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=2&ved=0CC8Q...

2005 Henderson, K.L., Y. Khrunyk, and J.R. Coats (2005). Differential metabolism and uptake of atrazine by three prairie grass species. Joint Regional Meeting of the Ozark-Prairie and MidSouth Chapters of the Society of Environmental Toxicology and Chemistry, Carbondale, IL.