Расселение кабана
Дикий кабан распространен на четырех из пяти континентов Земли, центром происхождения вида является Юго-Восточная Азия. Внутривидовая таксономия дикого кабана (SusscrofaL.) основанная преимущественно на экстерьерных признаках подтверждена иммуногенетическими исследованиями. Анализ ее с точки зрения молекулярно-генетических данных осложнялся тем, что данные с азиатской части ареала вида были весьма фргаментарными. Сведения о филогеографии и молекулярной филогении вида Susscrofa были основаны ранее на совместных данных для домашней свиньи и дикого кабана.
В нашей работе мы впервые построили филогенетическое дерево вида Susscrofaс привлечением только данных по диким животным и объемного материала из азиатской части ареала, в частности с территории Российской Федерации. Помимо задачи анализа филогенетических связей животных из разных частей ареала в Азии мы также рассмотрели вопрос о соответствии молекулярно-генетических данных существующей внутривидовой таксономии вида и известным кариологическим формам.
Материалом для анализа послужили 193 образца тканей диких кабанов, собранные в рамках данного исследования. Рассматривали фрагмент контрольного региона митохондриальной ДНК (далее – мтДНК) размером в 576 пар нуклеотидов и последовательности двух генов Y-хромосомы (USP9Yи AMELY)общей длиной 978 пар нуклеотидов. Для анализа филогении по мтДНК также были использованы 156 последовательностей, опубликованных на интернет-портале GenBank.
Полученные результаты позволили существенно расширить имеющиеся данные об эволюционной истории и закономерностях расселения дикого кабана в Азии. В частности, включение в анализ материалов с Кавказа и Забайкалья позволило увеличить надежность существующих филогенетических и филогеографических реконструкций. Была построена гипотеза о следующих путях расселения кабана из континентальной Юго-Восточной Азии:
- на запад в Индию, Непал, Пакистан и Шри-Ланку
- на север в Китай, Корею, Приморье и далее на запад до Ирана
- на запад, скорее всего, из Юго-Восточного Китая, далее южнее Гималаев до Ближнего Востока и далее в Европу.
Филогения, построенная на основании последовательностей генов Y-хромосомы, подтвердила анцестральное положение гаплотипов с островов Юго-Восточной Азии по отношению к континентальным гаплотипам, однако не выявила явных географических паттернов внутри континентальных генетических линий. Филогения вида по мтДНК в целом соответствует существующей «морфологической» внутривидовой таксономии.
Sung Kyoung Choi, Kyung Seok Kim, Maryana Ranyuk, Elmar Babaev, Inna Voloshina, Damdingiin Bayarlkhagva, Jong-Ryol Chong, Naotaka Ishiguro, Li Yu, Mi-Sook Min, Hang Lee, Nickolay Markov. Asiawide phylogeography of wild boar (Sus scrofa) based on mitochondrial DNA and Y-chromosome: Revising the migration routes of wild boar in Asia. // PLoS ONE 15(8): e0238049. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0238049
Asiawide phylogeography of wild boar (Sus scrofa) based on mitochondrial DNA and Y-chromosome: Revising the migration routes of wild boar in Asia. // PLoS ONE 15(8): e0238049. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0238049
Источники финансирования работы: проект РФФИ 20-04-00234